Z charizmy sv. sestry Faustíny vyrástla nielen nová škola duchovnosti, ale aj apoštolské hnutie Božieho Milosrdenstva, ktoré rôznym spôsobom napĺňa jej poslanie ohlasovať svetu Božie milosrdenstvo svedectvom života, skutky, slová a modlitbu.
Myšlienka tohto hnutia sa objavila vo Vilniuse v roku 1935, keď jej Ježiš povedal o túžbe, ktorá sa týkala založenia takejto kongregácie, ktorá by ohlasovala Božie milosrdenstvo svetu a vyprosovala ju pre svet (Denníček 436). Najprv si myslela, že musí odísť zo svojej kongregácie a založiť kontemplatívny kláštor, pre ktorý dokonca napísala aj rehoľnú regulu. Postupne však spoznala, že v tejto myšlienke nejde o jeden kláštor alebo jednu kongregáciu. V liste svojmu duchovnému sprievodcovi, o. Michalovi Sopočkovi začiatkom roka 1936 napísala: Jasne vidím, že to bude nielen ženská a mužská kongregácia, ale že to bude veľké združenie laikov, do ktorého môžu patriť všetci a skutkami budú ohlasovať Božie milosrdenstvo preukazovaním milosrdenstva jedni druhým. Nech sa Vám nezdá táto myšlienka šialenstvom, lebo je to úprimná pravda, ktorá sa onedlho stane skutkom a hoci by som nemala od nikoho podporu, aj tak ma nič neodradí, lebo mi stačí, že viem, že takáto je Božia vôľa. Naďalej si však myslela, že jej úlohou v tomto diele bude založiť kontemplatívny kláštor. Túžba po splnení tejto úlohy sa stala plátnom, na ktorom sa v jej živote uskutočnili bolestivé očisťovania ducha (rozumu a vôle), po ktorých dosiahla vrcholy zjednotenia s Bohom: mystické zásnuby. A napokon v mystických zážitkoch spoznala, že hoci toto dielo bude jedno, bude mať tri „odtiene“. Prvým sú kontemplatívne rehole, kde duše oddelené od sveta budú horieť ako obeta pred Božím trónom a vyprosovať milosrdenstvo pre celý svet a vyprosovať požehnanie pre kňazov. Svojou modlitbou budú pripravovať svet na druhý Ježišov príchod (Denníček 1155). Druhý odtieň tvoria činné kongregácie, ktoré budú kombinovať modlitbu a skutky milosrdenstva a v egoistickom svete sa budú usilovať prebúdzať lásku a Ježišovo milosrdenstvo (Denníček 1156). Tretí odtieň môže zahŕňať všetky osoby, ktoré nie sú viazané sľubmi a vo svete budú sprítomňovať milosrdnú Božiu lásku skrze život naplnený modlitbou a skutkami milosrdenstva. Člen tohto odtieňa – napísala sestra Faustína – by mal vykonať prinajmenšom jeden skutok milosrdenstva denne, ale môže ich byť veľa, lebo každému je ľahké ho vykonať (Denníček 1158).